生物反應器是利用酶或生物體（如微生物）所具有的生物功能，在體外進行生化反應的裝置系統，它是一種生物功能模擬機，如發酵罐、固定化酶或固定化細胞反應器等。在酒類、醫藥生產、濃縮果醬、果汁發酵、有機污染物降解方面有重要應用。